imcdatasets
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.imcdatasets
公开成像质量细胞术（IMC）数据集的收集
生物导体版本：版本（3.15）
IMCDATASET软件包可访问公开可用的IMC数据集。IMC是一项技术，可以从组织切片中测量> 40个蛋白质。可以将生成的图像分割以提取单个单元格数据。数据集通常由三个元素组成：一个包含单个单元数据的单元透明对象，一个包含多通道图像的细胞iMageList对象和一个包含用于从图像中提取单个单元格数据的单元格的细胞膜对象。
作者：尼古拉斯·达蒙德[AUT，CRE]
，尼尔斯[CTB]，Fischer Jana [CTB]
维护者：尼古拉斯·达蒙德（Nicolas Damond）
引用（从r内，输入引用（“ imcdatasets”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ imcdatasets”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ imcdatasets”）
| html | R脚本 | 访问IMC数据集 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.1 |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 4.2），Singlecellexperiment，，，，Cytomapper |
| 进口 | 方法，utils，实验室，，，，S4VECTORS，，，，延迟，，，，HDF5Array |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，降价，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/bodenmillergroup/imcdatasets |
| BugReports | https://github.com/bodenmillergroup/imcdatasets/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | imcdatasets_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/imcdatasets |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/imcdatasets |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/imcdatasets/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
