Gagedata

doi:10.18129/b9.bioc.gagedata

GAGE软件包的辅助数据

生物导体版本:版本(3.15)

这是适用于软件包Gage的支持性数据包。但是,这里提供的数据也可用于基因集或途径分析或微阵列数据分析。在此软件包中,我们提供了两个演示微阵列数据集:GSE16873(GEO的乳腺癌数据集)和BMP6(最初以GAGE的演示数据集发行,在GEO中也注册为GSE13604)。该软件包还包括基于KEGG途径的常用基因集数据,以及主要研究物种的GO术语,包括人,小鼠,大鼠和发芽酵母。还包括在芽酵母的常见基因ID之间进行映射数据。

作者:Weijun Luo

维护者:weijun luo

引用(从r内,输入引用(“ gagedata”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ GageData”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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细节

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版本 2.34.0
执照 GPL(> = 2.0)
要看 R(> = 2.10)
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链接
建议 量规,,,,PathView,,,,GeneFilter
系统要求
增强
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取决于我
进口我
建议我 量规
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构建报告

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跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gagedata_2.34.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gagedata
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/gagedata
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/gagedata/
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