生物导体版本:版本(3.15)
这是适用于软件包Gage的支持性数据包。但是,这里提供的数据也可用于基因集或途径分析或微阵列数据分析。在此软件包中,我们提供了两个演示微阵列数据集:GSE16873(GEO的乳腺癌数据集)和BMP6(最初以GAGE的演示数据集发行,在GEO中也注册为GSE13604)。该软件包还包括基于KEGG途径的常用基因集数据,以及主要研究物种的GO术语,包括人,小鼠,大鼠和发芽酵母。还包括在芽酵母的常见基因ID之间进行映射数据。
作者:Weijun Luo
维护者:weijun luo
引用(从r内,输入引用(“ gagedata”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ GageData”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 2.34.0 |
执照 | GPL(> = 2.0) |
要看 | R(> = 2.10) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 量规,,,,PathView,,,,GeneFilter |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 量规 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | gagedata_2.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gagedata |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/gagedata |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gagedata/ |
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