生物导体版本:版本(3.15)
该软件包为时间过程中的读取计数提供了一个远程膜的透明度对象,以响应于0、15、30、60、60、120和180分钟的氧化应激(1M山梨糖醇处理)的裂变酵母(schizosacachomyces pombe)。样品进一步分配在野生型组和删除ATF21的基团之间。读数计数矩阵是由研究作者准备并提供的:Leong HS,Dawson K,Wirth C,Li Y,Connolly Y,Smith DL,Wilkinson CR,Miller CJ。“全球非编码RNA系统可根据应力调节裂变酵母蛋白水平”。Nat Commun 2014 5月23日; 5:3947。PMID:24853205。GEO:GSE56761。
作者:迈克尔·洛夫
维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)
引用(从r内,输入引用(“裂变”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Fission”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“裂变”)
html | R脚本 | 裂变酵母时间课程 |
参考手册 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.16.0 |
执照 | LGPL |
要看 | r(> = 2.10),总结性特征 |
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建议 | 尼特,,,,降价 |
系统要求 | |
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取决于我 | rnaseqgene,,,,Rocpai |
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构建报告 |
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源包 | fission_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fission |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/裂变 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/fession/ |
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