emtdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.emtdata

一个关于上皮细胞向间充质细胞转变(EMT)数据集的实验包

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该包提供了在细胞系上诱导上皮细胞向间充质细胞转变的预处理RNA-seq数据。这些数据来自三份出版物Cursons等人(2015)，Cursons等人(2018)和Foroutan等人(2017)。在这些出版物中，在TGFb和其他兴奋剂治疗后，EMT在多个细胞系中被诱导。这些数据将有助于确定为实现EMT而修改的监管计划。数据由WEHI生物信息学部门的戴维斯实验室处理。

作者:Malvika D. Kharbanda [aut, cre]，陈志伟[aut]，达米什·d·布瓦[au]

维护者:Malvika D. Kharbanda < Kharbanda。M在wehi.edu.au>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“emtdata”)

超文本标记语言	R脚本	emtdata
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文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.6.0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1)
进口	刨边机，ExperimentHub，SummarizedExperiment
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),stringr，plyr，prettydoc，BiocStyle，Homo.sapiens，RColorBrewer，rmarkdown，BiocFileCache，knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/DavisLaboratory/emtdata
BugReports	https://github.com/DavisLaboratory/emtdata/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	emtdata_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/emtdata
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/emtdata
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/emtdata/
软件包下载报告	下载数据