呼吸道

doi:10.18129/b9.bioc.airway

Himes等人2014

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包为在四个用地塞米松处理的人类气道平滑肌细胞系上进行了RNA-Seq实验,为基因中的读数读数提供了一个远程膜化的对象。包装插图中提供了有关基因模型和读取过程的详细信息。实验的引用是:Himes Be,江内X,瓦格纳P,Hu R,Wang Q,Klanderman B,Whitaker RM,Duan Q,Lasky-Su J,Nikolos C,Jester C,Jester W,Johnson M,Johnson M,Panettieri R JR,Tantisira,Tantisira,Tantisira,TantisiraKG,Weiss St,Lu Q.'RNA-Seq转录组分析表将CRISPLD2鉴定为一种糖皮质激素反应性基因,可调节气道平滑肌细胞中的细胞因子功能。PLOS ONE。2014年6月13日; 9(6):E99625。PMID:24926665。GEO:GSE52778。

作者:迈克尔·洛夫

维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)

引用(从r内,输入引用(“气道”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ airway”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“气道”)

html R脚本 气道平滑肌细胞
PDF 参考手册

细节

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版本 1.16.0
执照 LGPL
要看 r(> = 3.5.0),总结性特征
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包装档案

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源包 airway_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/airway
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/气道
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/airway/
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