生物导体版本:版本(3.15)
该软件包提供了人类HG19/HG38组件上的全基因组映射轨道。如果多个编码区域与相同的垃圾箱重叠,我们采用了编码项目的100-MERS映射轨道,并计算出映射得分的加权平均值。包括“黑名单”垃圾箱,包括端粒,丝粒和/或异染色质区域的参考组装中的分段重复区域和差距。该数据集由三个组装的单细胞总基因组测序的组装.BAM文件组成,用于说明目的。
作者:Rujin Wang
维护者:rujin wang
引用(从r内,输入引用(“ WGSMAPP”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ WGSMAPP”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.8.0 |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.6.0),基因组机 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
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取决于我 | |
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建议我 | 范围 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | wgsmapp_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wgsmapp |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/wgsmapp |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/wgsmapp/ |
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