tmexplorer

doi:10.18129/b9.bioc.tmexplorer

肿瘤微环境单细胞RNA测序数据集和相应的元数据的集合

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包提供了一种工具,可以搜索和下载肿瘤微环境单细胞RNA测序数据集及其元数据的集合。TMExplorer的目标是为希望在单细胞水平研究肿瘤微环境的用户充当单点入口。用户可以使用元数据表快速搜索可用的数据集,然后下载他们感兴趣的用于分析的数据集。

作者:Erik Christensen [AUT,CRE],Alaine Naidas [aut],Parisa Shooshtari [aut]

维护者:erik christensen

引用(从r内,输入引用(“ tmexplorer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ tmexplorer”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ tmexplorer”)

html R脚本 tmexplorer
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.2.1
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.1),Singlecellexperiment,,,,Biocfilecache
进口 方法,矩阵
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/shooshtarilab/tmexplorer/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tmexplorer_1.2.1.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tmexplorer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tmexplorer
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/tmexplorer/
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