Bioconductor版本:发行版(3.16)
由10X Genomics收集的Visium空间基因表达数据集,格式化为SpatialExperiment类的对象。数据涵盖了各种生物和组织,包括:单节和多节实验,以及单节进行了整个转录组和靶向面板分析。数据集可以用于包中的测试和示例,用于教程和工作流演示,或类似的目的。
维护者:Helena L. Crowell < Helena at Crowell .eu>
引用(从R中,输入引用(“TENxVisiumData”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TENxVisiumData")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“TENxVisiumData”)
超文本标记语言 | R脚本 | TENxVisiumData |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.6.0 |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | ExperimentHub,SpatialExperiment |
进口 | 跑龙套 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/helenalc/TENxVisiumData |
BugReports | https://github.com/helenalc/TENxVisiumData/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 关注的焦点 |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | TENxVisiumData_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/TENxVisiumData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TENxVisiumData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TENxVisiumData/ |
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