Bioconductor版本:发行版(3.16)
该实验数据包包含遵循“TCGA工作流:使用Bioconductor包分析癌症基因组学和表观基因组学数据”所需的11个数据集。
作者:Tiago Chedraoui Silva
维护者:Tiago Chedraoui Silva
引文(从R内,输入引用(“TCGAWorkflowData”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TCGAWorkflowData")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TCGAWorkflowData”)
超文本标记语言 | R脚本 | TCGA的示例数据工作流:使用Bioconductor包分析癌症基因组学和表观基因组学数据 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.22.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | SummarizedExperiment |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,老鸨,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://f1000research.com/articles/5-1542/v2 |
BugReports | https://github.com/BioinformaticsFMRP/TCGAWorkflow/issues |
全靠我 | |
进口我 | TCGAWorkflow |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TCGAWorkflowData_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TCGAWorkflowData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TCGAWorkflowData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TCGAWorkflowData/ |
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