Singlecellmultimodal
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doi：10.18129/b9.bioc.singlecellmultimodal
集成多模式单细胞实验数据集
生物导体版本：版本（3.15）
SinglecellMultimodal是一个实验室软件包，它提供从GEO和其他来源获得的多个数据集，并将其表示为多亚sayExexperiment对象。我们提供了几个多模式数据集，包括SCNMT，10倍多组，seqfish，Citeseq，Scope2等。包装的范围是提供用于基准测试和分析的数据。
作者：Marcel Ramos [AUT，CRE]
，Ricard Argelaguet [aut]，Dario Righelli [aut]，Kelly Eckenrode [aut]，Levi Waldron [aut]
维护者：Marcel Ramos
引用（从r内，输入引用（“ Singlecellmultimodal”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ singlecellmultimodal”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Singlecellmultimodal”）
| html | R脚本 | Citeseq脐带血 |
| html | R脚本 | Ecciteseq外周血 |
| html | R脚本 | GT-Seq小鼠胚胎 |
| html | R脚本 | Scmultiome 10x PBMC |
| html | R脚本 | SCNMT小鼠胃肠道 |
| html | R脚本 | Scope2：巨噬细胞与单核细胞 |
| html | R脚本 | seq鱼鼠标视觉皮层 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 4.1.0），多亚sayExexperiment |
| 进口 | AnnotationHub，，，，Biocfilecache，，，，生物基因，，，，实验室，，，，HDF5Array，，，，S4VECTORS，，，，Singlecellexperiment，，，，Spatiaxlexperiment，，，，总结性特征，，，，矩阵，方法，utils |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，GGPLOT2，，，，尼特，，，，破烂的经历，，，，rmarkDown，，，，评分，，，，斯克兰，，，，insctr，，，，UWOT |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/waldronlab/singlecellemultimodal/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | Mudata |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | singlecellmultimodal_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singlecellemultimodal |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/singlecellmultimodal |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/singlecellemultimodal/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
