single.mtec.transcriptomes
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doi：10.18129/b9.bioc.single.mtec.transcriptomes
单细胞转录组数据和小鼠MTEC细胞的分析
生物导体版本：版本（3.15）
该数据包包含用于分析单细胞RNA-seq的代码和来自手稿的大量ATAC-SEQ数据，标题为：单细胞转录组分析揭示了髓质胸腺上皮细胞中协调的异位 - 基因表达模式。本文发表在《自然免疫学》 16,933-941（2015）中。此软件包中提供的数据对象已进行了预处理：可以从登录标识符E-MTAB-3346和E-MTAB-3624下载原始数据文件。此数据包的小插图提供了一个记录的且可重复的工作流程，其中包括用于生成每个统计量的代码和手稿中的数字。
作者：亚历杭德罗·雷耶斯
维护者：Alejandro Reyes
引用（从r内，输入引用（“ single.mtec.transcriptomes”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ single.mtec.transcriptomes”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ single.mtec.transcriptomes”）
| R脚本 | 分析单细胞MTEC数据。 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 执照 | LGPL |
| 要看 | R（> = 3.5.0） |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | deseq2，，，，基因组机，，，，GenomicFeatures，，，，GeneFilter，，，，Statmod，，，，gdata，，，，rcolorbrewer，，，，GGPLOT2，，，，GPLOTS，，，，簇，，，，线索， 网格，栅格，，，，GGBIO，，，，GVIZ，，，，Geneplotter，，，，矩阵，，，，pheatmap，，，，生物使用，，，，尼特，，，，生物比较 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
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| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | single.mtec.transcriptomes_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/single.mtec.transcriptomes |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/single.mtec.transcriptomes |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/single.mtec.transcriptomes/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
