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RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp
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DOI:10.18129 / B9.bioc.RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp
RcisTarget主题数据库对人类(hg19) - 4.6 k图案的子集
Bioconductor版本:版本(3.16)
RcisTarget数据库:基于基因的转录因子主题排名和注释。这个包包含了4.6 k图案的一个子集(cisbp图案),得分仅在500英国石油公司上游和TSS。看到RcisTarget教程下载完整的数据库,包含20 k图案和搜索空间10 kbp TSS。
作者:Sara Aibar,哥特Hulselmans, Aerts斯坦。计算生物学的实验室,KU鲁汶人类遗传学中心。比利时鲁汶。
维护人员:莎拉Aibar <萨拉。在kuleuven.vib.be aibar >
从内部引用(R,回车引用(“RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.3) |
| 进口 | data.table |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://scenic.aertslab.org |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | RcisTarget |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
