rtcga.cnv

doi:10.18129/b9.bioc.rtcga.cnv

癌症基因组项目的CNV(拷贝数变化)数据集

生物导体版本:版本(3.15)

软件包从http://gdac.broadinstitute.org/中提供了来自癌症基因组项目的CNV(基于Merge SNP)数据集。数据格式在此处解释https://wiki.nci.nih.gov/display/tcga/tcga/retrieving+data+luest+the+data+attrix。2015-11-01快照的数据。

作者:przemyslaw biecek

维护者:Marcin Kosinski

引用(从r内,输入引用(“ rtcga.cnv”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ rtcga.cnv”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rtcga.cnv”)

html R脚本 使用RTCGA下载rtcga.cnv中包含的CNV数据
html R脚本 使用RTCGA与MDM2重复的估计比
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.24.0
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.3.0),RTCGA
进口
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/rtcga/rtcga/issues
取决于我
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建议我 RTCGA
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rtcga.cnv_1.24.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rtcga.cnv
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rtcga.cnv
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rtcga.cnv/
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