RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

RNAseq实验:通过高通量测序HNRNPC敲低和对照HeLa细胞的转录分析

Bioconductor版本:发行版(3.13)

该包包含8个BAM文件，每运行一个测序文件。每个BAM文件通过以下步骤获得:(1)用TopHat2将reads(配对端)对准hg19完整基因组，然后(2)将子集设置为只对chr14进行对准。有关实验的详细信息，请参阅ArrayExpress数据库中的登录号E-MTAB-1147，包括已发表的研究(扎纳克等人，2012年)和FASTQ文件的链接。

作者:Hervé Pagès

维护者:Hervé Pagès

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

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版本	0.30.0
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	GenomicAlignments,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1147/
全靠我	samExploreR,测序
进口我
建议我	BiocParallel,GenomicAlignments,GenomicFiles,GenomicRanges,咆哮,Rsamtools,SplicingGraphs
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14_0.30.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14/
软件包下载报告	下载数据