NxtIRFdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.NxtIRFdata

数据NxtIRF

Bioconductor版本:版本(3.16)

NxtIRFdata SpliceWiz同伴包,一个交互式分析和可视化工具,可变剪接定量RNA-seq BAM文件(包括基因内区保留)。NxtIRFdata包含人类和小鼠的生成所需的Mappability文件引用。BAM NxtIRFdata还包含一个合成基因组参考和例子文件用于演示SpliceWiz的功能。BAM文件是基于6提供的Leucegene数据集样本NCBI基因表达综合下加入GSE67039数量。

作者:亚历克斯芽黄黑(cre, aut cph], Ulf施密茨(施)

维修工:亚历克斯芽黄黑<。黄在centenary.org.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NxtIRFdata”)

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文档

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browseVignettes (“NxtIRFdata”)

HTML	R脚本	NxtIRFdata: NxtIRF的数据包
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.4.0
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口	ExperimentHub,BiocFileCache,rtracklayer,R.utils
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/alexchwong/NxtIRFdata
BugReports	https://support.bioconductor.org/
取决于我	NxtIRFcore,SpliceWiz
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	NxtIRFdata_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NxtIRFdata
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NxtIRFdata
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NxtIRFdata/
包下载报告	下载数据