HarmanData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HarmanData

哈曼包的数据

Bioconductor版本:发行版(3.16)

数据集的陪同哈曼,PCA和约束优化为基础的技术。包含三个示例数据集:IMR90,人肺成纤维细胞暴露于一氧化氮;NPM,一项在未怀孕的小鼠身上局部涂抹防晒霜后,测试金属氧化物纳米颗粒穿透皮肤的实验;OLF;一项测量人类嗅觉神经球来源(hONS)细胞对ZnO纳米颗粒反应的实验。自1.24版本以来,该软件包还包含Infinium5数据集,一组跨5个Illumina Infinium甲基化BeadChip数据集的批量校正调整。此文件中没有甲基化数据,而是5个数据集校正后的汇总统计。还有一个EpiSCOPE_sample文件作为Harman中新的甲基化聚类功能的示例。

作者:Yalchin Oytam [aut], Josh Bowden [aut], Jason Ross [aut, cre]

维护者:Jason Ross < Jason。罗斯在csiro.au>

引文(从R内,输入引用(“HarmanData”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HarmanData”)

超文本标记语言 R脚本 HarmanData
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.26.0
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.5.0)
进口
链接
建议 BiocGenericsBiocStyleknitrrmarkdown哈曼(> = 1.23.3)
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bioinformatics.csiro.au/harman/
全靠我
进口我
建议我 哈曼
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 HarmanData_1.26.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HarmanData
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HarmanData
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HarmanData/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网