Bioconductor版本:发行版(3.16)
数据集的陪同哈曼,PCA和约束优化为基础的技术。包含三个示例数据集:IMR90,人肺成纤维细胞暴露于一氧化氮;NPM,一项在未怀孕的小鼠身上局部涂抹防晒霜后,测试金属氧化物纳米颗粒穿透皮肤的实验;OLF;一项测量人类嗅觉神经球来源(hONS)细胞对ZnO纳米颗粒反应的实验。自1.24版本以来,该软件包还包含Infinium5数据集,一组跨5个Illumina Infinium甲基化BeadChip数据集的批量校正调整。此文件中没有甲基化数据,而是5个数据集校正后的汇总统计。还有一个EpiSCOPE_sample文件作为Harman中新的甲基化聚类功能的示例。
作者:Yalchin Oytam [aut], Josh Bowden [aut], Jason Ross [aut, cre]
维护者:Jason Ross < Jason。罗斯在csiro.au>
引文(从R内,输入引用(“HarmanData”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HarmanData”)
超文本标记语言 | R脚本 | HarmanData |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.26.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,BiocStyle,knitr,rmarkdown,哈曼(> = 1.23.3) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bioinformatics.csiro.au/harman/ |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 哈曼 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | HarmanData_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HarmanData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HarmanData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HarmanData/ |
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