hsmmsinglecell
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.hsmmsinglecell
单细胞RNA-Seq用于区分人体骨骼肌成肌细胞（HSMM）
生物导体版本：版本（3.15）
骨骼肌细胞在分化过程中经历了形态和转录变化的特征序列。在该实验中，原发性人骨骼肌成肌细胞（HSMM）在高丝裂原条件（GM）下扩展，然后通过切换到低丝裂料培养基（DM）来区分。从数百个细胞中的每个细胞中的每个细胞中的每个细胞中的每个细胞中测序了RNA-Seq库。使用流体C1微流体系统血清开关后，在四个时间点（0、24、48、72小时）的每个时间点（0、24、48、72小时）中捕获了49至77个细胞之间。分离来自每个细胞的RNA并用于构造mRNA-Seq库，然后将其测序为每个库的深度约为400万个读取，从而为每个细胞提供完整的基因表达谱。
作者：科尔·特拉普内尔
维护者：broadinstitute.org>的科尔·特拉普内尔（Cole Trapnell）
引用（从r内，输入引用（“ hsmmsinglecell”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ hsmmsinglecell”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.16.0 |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 2.10） |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 单片 |
| 建议我 | Celltree，，，，ctggem |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | hsmmsinglecell_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hsmmsinglecell |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/hsmmsinglecell |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/hsmmsinglecell/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
