- 家
- Biocumon 3.13
- 实验包
- hmp16sdata.
hmp16sdata.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.hmp16sdata.
16S来自人类微生物组项目的RRNA测序数据
Bioconductor版本：释放（3.13）
HMP16SDATA是可变区1-3和3-5的人微生物族项目（HMP）16S RRNA测序数据的生物导音器实验。从HMP数据分析和协调中心下载的包中提供了原始数据文件。经过实验室，处理数据作为摘要提供类对象。
作者：Lucas Schiffer [Aut，CRE]
，Rimsha Azhar [Aut]，Marcel Ramos [CTB]，Ludwig Geistlinger [CTB]，Levi Waldron [Aut]
维护者：Lucas Schiffer
引文（从R内，输入引文（“HMP16SDATA”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percenamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“hmp16sdata”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“HMP16SDATA”）
| HTML. | r script. | hmp16sdata. |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 执照 | 艺术-2.0 |
| 依靠 | r（> = 4.0.0），概括分析 |
| 进口 | annotationhub.那assertthat.那dplyr.那实验室那kableextra那kn那Magrittr.， 方法，读书那S4Vectors.那stringr.那娇媚，实用程序 |
| 链接到 | |
| 建议 | BioBase.那bioccheck.那Biocmanager.那生物焦那盘旋那Covr.那电台那dendextend.那devtools.那ggplot2.那格拉底那避风港那文学那RAMAMAMDOW.那Roxygen2.，统计，testthat.那Tidyr. |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | https://github.com/waldronlab/hmp16sdata. |
| Bugreports. | https://github.com/waldronlab/hmp16sdata/issues. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | hmp16sdata_1.12.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | |
| Macos 10.13（高塞拉） | |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/hmp16sdata. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocumon.org：包/ hmp16sdata |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/hmp16sdata/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
