FlowSorted.Blood.EPIC

DOI:10.18129 / B9.bioc.FlowSorted.Blood.EPIC

免疫磁分选成人外周血的Illumina EPIC数据

Bioconductor版本:发布(3.15)

原始数据对象将用于血细胞比例估计在迷你和类似的包。FlowSorted.Blood.EPIC对象基于Brock Christensen及其同事分析的样本;详见Salas et al. 2018。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE110554。

作者:Lucas A. Salas [cre, aut]， Devin C. Koestler [aut]， Rondi A. Butler [ctb]， Helen M. Hansen [ctb]， John K. Wiencke [ctb]， Karl T. Kelsey [ctb]， Brock C. Christensen [ctb]， Kasper Daniel Hansen [ctb](原始minfi estimateCellCounts和内部函数的作者和维护者)，Jean-Philippe Fortin [ctb](原始minfi estimateCellCounts和内部函数的贡献者)，Shan V. Andrews [ctb](原始minfi estimateCellCounts和内部函数的贡献者)，E. Andres Houseman [ctb](用于细胞投影的原始二次规划函数的作者)，Andrew E. Jaffe [ctb](原始estimateCellCounts和minfi内部函数的作者)

维护者:Lucas A. Salas < Lucas .a.salas。Diaz，达特茅斯。edu b>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" flowsored . blood . epic ")

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文档

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browseVignettes(“FlowSorted.Blood.EPIC”)

超文本标记语言	R脚本	FlowSorted.Blood.EPIC
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	2.0.0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5)，minfi(> = 1.21.2),ExperimentHub
进口	genefilter，nlme，quadprog，图形，统计，utils，AnnotationHub，SummarizedExperiment，S4Vectors
链接
建议	knitr，rmarkdown，FlowSorted.CordBlood.450k，FlowSorted.Blood.450k(> = 1.0.1),EpiDISH，FlowSorted.CordBloodNorway.450k，testthat，IlluminaHumanMethylation450kmanifest(> = 0.2.0),IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19(> = 0.2.1),IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19
SystemRequirements
增强了	FlowSorted.CordBloodCombined.450k(> = 1.11.5)
URL	https://github.com/immunomethylomics/FlowSorted.Blood.EPIC
BugReports	https://github.com/immunomethylomics/FlowSorted.Blood.EPIC/issues。
这取决于我
进口我
建议我	DMRcate，FlowSorted.CordBloodCombined.450k，西瓜
链接到我
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包档案

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源包	FlowSorted.Blood.EPIC_2.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/FlowSorted.Blood.EPIC
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/FlowSorted.Blood.EPIC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FlowSorted.Blood.EPIC/
软件包下载报告	下载数据