targetscan.Mm.eg.db

DOI:10.18129 / B9.bioc.targetscan.Mm.eg.db

TargetScan小鼠miRNA靶点预测

Bioconductor版本:发行版(3.16)

TargetScan miRNA目标预测使用TargetScan网站的数据组装的小鼠。TargetScan通过搜索与每个miRNA的种子区域相匹配的保守的8mer和7mer位点来预测miRNA的生物学靶点。此外,还发现了种子区域的错配位点,这些错配位点通过保守的3'配对得到补偿。在哺乳动物中,预测是基于预测的靶向效果进行排名的,这是通过使用站点的上下文分数计算得出的。

作者:Gabor Csardi

维护者:James F. Reid < James。里德在ifom-ieo-campus.it>

引文(从R内,输入引用(“targetscan.Mm.eg.db”)):

安装

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如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("targetscan. mm . e.g. .db")

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