targetscan.Mm.eg.db

DOI:10.18129 / B9.bioc.targetscan.Mm.eg.db

TargetScan小鼠miRNA靶点预测

Bioconductor版本:发行版(3.16)

TargetScan miRNA目标预测使用TargetScan网站的数据组装的小鼠。TargetScan通过搜索与每个miRNA的种子区域相匹配的保守的8mer和7mer位点来预测miRNA的生物学靶点。此外，还发现了种子区域的错配位点，这些错配位点通过保守的3'配对得到补偿。在哺乳动物中，预测是基于预测的靶向效果进行排名的，这是通过使用站点的上下文分数计算得出的。

作者:Gabor Csardi

维护者:James F. Reid < James。里德在ifom-ieo-campus.it>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("targetscan. mm . e.g. .db")

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文档

PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	0.6.1
许可证	文件许可证
取决于	R(>= 2.7.0)，方法，AnnotationDbi(> = 1.18.3)
进口	方法,AnnotationDbi
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包档案

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源包	targetscan.Mm.eg.db_0.6.1.tar.gz
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macOS二进制文件(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/targetscan.Mm.eg.db/
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