SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38

从dbSNP Build 155中提取的人类SNP位点和等位基因,并放置在GRCh38/hg38组件上

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该包中的949,021,448个snp是从位于https://ftp.ncbi.nih.gov/snp/archive/b155/JSON/的1-22号染色体、X、Y和MT的RefSNP JSON文件中提取的(这些文件是由NCBI在2021年5月创建的)。这些snp可以被“注入”到bsgome . hsapiens . ncbi中。GRCh38或BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。

作者:Herve页面

维护器:Hervé Pagès

引用(从R中,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38”)):

安装

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文档

PDF 参考手册

细节

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版本 0.99.22
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 4.2.0),BSgenome
进口 方法,跑龙套,BiocGenericsS4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesBSgenome
链接
建议 BiostringsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
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源包 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38_0.99.22.tar.gz
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包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38/
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