SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38

智人的SNP位点(dbSNP Build 149)

生物导体版本:发布(3.13)

从NCBI dbSNP Build 149中提取的智人的SNP位点和等位基因。该包使用的源数据文件由NCBI于2016年11月8日至12日之间创建，包含指向参考基因组GRCh38的snp。p7 (GRCh38的一个补丁版本，不改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意这些SNPs可以“注入”到bsgenome . haspens . ncbi中。GRCh38或BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。

作者:Herve页面

维护者:H. Pagès

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install(" snplocs . haspenss . dbsnp148 . grch38 ")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

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版本	0.99.20
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.43.4)
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，BSgenome
链接
建议	Biostrings，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	MafDb.1Kgenomes.phase1.GRCh38，MafDb.1Kgenomes.phase3.GRCh38，MafDb.ExAC.r1.0.GRCh38，MafDb.ExAC.r1.0.nonTCGA.GRCh38，MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38，MafDb.gnomAD.r3.0.GRCh38，MafDb.gnomADex.r2.1.GRCh38，MafDb.TOPMed.freeze5.hg38，MafH5.gnomAD.r3.0.GRCh38，MafH5.gnomAD.v3.1.1.GRCh38
我的链接

包档案

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源包	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38_0.99.20.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38/
包下载报告	下载数据