生物导体版本:发布(3.13)
从NCBI dbSNP Build 144中提取的智人SNP位点和等位基因。NCBI于2015年5月30日创建了该包的源数据文件,包含了指向参考基因组GRCh38的snp。p2 (GRCh38的一个补丁版本,它不会改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意这些SNPs可以“注入”到bsgenome . haspens . ncbi中。GRCh38或BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。
作者:Herve页面
维护者:H. Pagès
引文(从R中输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install(" snplocs . haspenss . dbsnp144 . grch38 ")
有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放。
参考手册 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 0.99.20 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.43.4) |
进口 | 方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | BSgenome,GenomicFeatures,MungeSumstats,XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38 |
我的链接 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.20.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/ |
包下载报告 | 下载数据 |