这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。
生物导体版本:版本(3.15)
从NCBI DBSNP构建中提取的HOMO SAPIENS的SNP位置和等位基因132.该软件包使用的源数据文件是由NCBI于2010年11月9日创建的,包含映射到参考基因组GRCH37的SNP。警告:请注意,除线粒体染色体外,GRCH37基因组与UCSC的HG19基因组相同。因此,该软件包中的SNP可以“注入” bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中,但是该注入将排除CHRM(即,该序列中不会注入任何内容)。
作者:HervéPagès
维护者:h.pagès
引用(从r内,输入引用(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 0.99.9 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10),iranges,,,,基因组机 |
进口 | 方法,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机 |
链接 | |
建议 | 生物弦,,,,BSGENOME(> = 1.16.1),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 变体 |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109_0.99.9.99.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109/ |
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