snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109

doi:10.18129/b9.bioc.snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

HOMO SAPIENS的SNP位置(DBSNP Build 132)

生物导体版本:版本(3.15)

从NCBI DBSNP构建中提取的HOMO SAPIENS的SNP位置和等位基因132.该软件包使用的源数据文件是由NCBI于2010年11月9日创建的,包含映射到参考基因组GRCH37的SNP。警告:请注意,除线粒体染色体外,GRCH37基因组与UCSC的HG19基因组相同。因此,该软件包中的SNP可以“注入” bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中,但是该注入将排除CHRM(即,该序列中不会注入任何内容)。

作者:HervéPagès

维护者:h.pagès

引用(从r内,输入引用(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

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版本 0.99.9
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.10),iranges,,,,基因组机
进口 方法,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机
链接
建议 生物弦,,,,BSGENOME(> = 1.16.1),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 变体
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109_0.99.9.99.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109/
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