JASPAR2022

DOI:10.18129 / B9.bioc.JASPAR2022

数据包JASPAR数据库(2022年版)

Bioconductor版本:版本(3.16)

JASPAR包含手动策划,是一个开放数据库冗余转录因子(TF)绑定TFs在6个分类群的概要文件。在这9日发布,我们扩大了核心与341年收集新的概要文件(脊椎动物148种植物,101,85,有尾索的昆虫和7),对应于一个19%扩张前发布。thisdatabases搜索,请使用包TFBSTools (> = 1.31.2)。

作者:一Baranasic (aut (cre)

维护人员:一Baranasic <一。在lms.mrc.ac.uk baranasic >

从内部引用(R,回车引用(“JASPAR2022”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“JASPAR2022”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“JASPAR2022”)

HTML R脚本 JASPAR2022
PDF 参考手册

细节

biocViews bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本 0.99.7
许可证 GPL-2
取决于 R(> = 4.1.0)、方法BiocFileCache,跑龙套
进口
链接
建议 knitr,rmarkdown,BiocStyle,TFBSTools(> = 1.31.2)
SystemRequirements
增强了
URL http://jaspar.genereg.net/
取决于我
进口我
建议我 MethReg
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 JASPAR2022_0.99.7.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/JASPAR2022/
包下载报告 下载数据

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