生物导体版本:版本(3.15)
该软件包包含用于从不同注释来源(例如Gencode)构建基因组状态对象的功能。它还可以在JHPCE上访问这些文件。
作者:Leonardo Collado-Torres [AUT,CRE]
维护者:leonardo collado-torres
引用(从r内,输入引用(“基因组状态”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ GenomicState”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“基因组态”)
html | R脚本 | 基因组构想简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 0.99.15 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | AnnotationHub |
进口 | GenomicFeatures,,,,GenomeInfodB,,,,rtracklayer,,,,Bumphunter,,,,德芬德(> = 1.21.7),AnnotationDbi,,,,iranges,,,,org.hs.eg.db,utils,方法 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,SessionInfo,,,,测试(> = 2.1.0),胶水,,,,derfinderplot,,,,AnnotationHubdata,,,,Refmanager,,,,基因组机,,,,COVR |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/lieberinstitute/genomicstate |
BugReports | https://support.bioconductor.org/t/genomicstate |
取决于我 | |
进口我 | BrainflowProbes,,,,recountworkflow |
建议我 | 达斯珀 |
链接到我 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | genomicstate_0.99.15.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/genomicstate/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |