基因组态

doi:10.18129/b9.bioc.genomicstate

构建和访问GenomicState对象,以与Gencode之类的源与DERFINDER工具一起使用

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包包含用于从不同注释来源(例如Gencode)构建基因组状态对象的功能。它还可以在JHPCE上访问这些文件。

作者:Leonardo Collado-Torres [AUT,CRE]

维护者:leonardo collado-torres

引用(从r内,输入引用(“基因组状态”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ GenomicState”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“基因组态”)

html R脚本 基因组构想简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 0.99.15
执照 艺术2.0
要看 AnnotationHub
进口 GenomicFeatures,,,,GenomeInfodB,,,,rtracklayer,,,,Bumphunter,,,,德芬德(> = 1.21.7),AnnotationDbi,,,,iranges,,,,org.hs.eg.db,utils,方法
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,SessionInfo,,,,测试(> = 2.1.0),胶水,,,,derfinderplot,,,,AnnotationHubdata,,,,Refmanager,,,,基因组机,,,,COVR
系统要求
增强
URL https://github.com/lieberinstitute/genomicstate
BugReports https://support.bioconductor.org/t/genomicstate
取决于我
进口我 BrainflowProbes,,,,recountworkflow
建议我 达斯珀
链接到我

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 genomicstate_0.99.15.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genomicstate/
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