EuPathDB

DOI:10.18129 / B9.bioc.EuPathDB

提供对EuPathDB数据库上可用的病原体注释资源的访问

Bioconductor版本:发行版(3.13)

汇集了来自各种EuPathDB数据库(PlasmoDB, ToxoDB, TriTrypDB等)的注释资源，并使用AnnotationHub框架在R中提供它们。

作者:Keith Hughitt [aut, cre]

维护者:Keith Hughitt < Keith。休itt在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("EuPathDB")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“EuPathDB”)

超文本标记语言	R脚本	使用AnnotationHub访问EuPathDB资源
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文本		新闻

细节

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版本	1.0.1
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)，Biobase，GenomicRanges，GenomeInfoDbData，AnnotationHub(> = 2.13.8)
进口	AnnotationHubData，Biostrings，BiocManager,跑龙套
链接
建议	dplyr，knitr，BiocStyle，rmarkdown，jsonlite
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/khughitt/EuPathDB
BugReports	https://github.com/khughitt/EuPathDB/issues
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进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	EuPathDB_1.0.1.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EuPathDB/
软件包下载报告	下载数据