BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked

带绦虫全掩膜基因组序列(UCSC版本taeGut1)

Bioconductor版本:发行版(3.16)

斑马雀(Taeniopygia guttata)的完整基因组序列由UCSC提供(taeGut1, july 2008)并存储在Biostrings对象中。序列与BSgenome.Tguttata.UCSC相同。taeGut1，除了它们每个都在上面有以下2个掩码:(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码)和(2)contig内歧义掩码(AMB掩码)。默认情况下，两个掩码都是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . tguttata . ucsc . taegut1 .mask ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

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版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.11),BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1
进口	BSgenome，BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1
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包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked/
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