BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked

智人全掩模基因组序列(UCSC版本hg38，基于GRCh38.p13)

Bioconductor版本:发行版(3.16)

由UCSC提供的智人(人类)全基因组序列(基因组hg38，基于GRCh38.p13)，并存储在Biostrings对象中。序列与bsgome . hsapiens . ucsc中相同。hg38，但每个掩码上都有以下4个掩码:(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)contig内歧义掩码(AMB掩码)，(3)RepeatMasker中的重复掩码(RM掩码)，以及(4)Tandem repeats Finder中的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . hsapiens . ucsc .hg .mask ")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

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版本	1.4.4
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),BSgenome(> = 1.60.0),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
进口	BSgenome，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
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包档案

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源包	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked_1.4.4.tar.gz
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macOS二进制(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked/
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