bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked

doi:10.18129/b9.bioc.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked

Homo Sapiens的完整蒙版基因组序列(UCSC版本HG19,基于GRCH37.P13)

生物导体版本:版本(3.15)

由UCSC(基于GRCH37.P13)提供的Homo Sapiens(人)的完整基因组序列(人类),并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中的序列相同,除了它们每个序列都在顶部具有4个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(Agaps mask)(agaps mask),(2)contra内部掩码歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。

作者:生物导体开发团队

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