生物导体版本:版本(3.15)
由UCSC(基于GRCH37.P13)提供的Homo Sapiens(人)的完整基因组序列(人类),并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中的序列相同,除了它们每个序列都在顶部具有4个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(Agaps mask)(agaps mask),(2)contra内部掩码歧义(Ambmask),(3)RepotMasker(RM Mask)的重复掩码,以及(4)串联重复搜索器(TRF蒙版)的重复掩码。默认情况下,只有agaps和amb掩模是“活动”的。
作者:生物导体开发团队
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
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版本 | 1.3.993 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.5.0),BSGENOME(> = 1.54.0),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
进口 | BSGENOME,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
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建议我 | cnvfilter,,,,库务,,,,核粒子,,,,R3CSEQ,,,,区域人,,,,RSVSIM,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37 |
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源包 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked_1.3.993.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked/ |
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