BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17.masked

智人全掩模基因组序列(UCSC版本hg17)

Bioconductor版本:发行版(3.16)

智人(人类)的完整基因组序列由UCSC提供(hg17, 2004年5月)并存储在Biostrings对象中。序列与BSgenome.Hsapiens.UCSC相同。hg17，除了它们每个上面都有以下4个掩码:(1)装配间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)contig内歧义掩码(AMB掩码)，(3)RepeatMasker中的重复掩码(RM掩码)，以及(4)Tandem repeats Finder中的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . hsapiens . ucsc .hg17.mask ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

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版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17
进口	BSgenome，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17
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源包	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17.masked_1.3.99.tar.gz
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包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17.masked/
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