BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked

斑马鱼全遮罩基因组序列(UCSC版本danRer7)

Bioconductor版本:发行版(3.16)

斑马鱼(Danio rerio)的完整基因组序列由UCSC提供(danRer7, 2010年7月)并存储在Biostrings对象中。序列与bsgenome . dreri . ucsc相同。danRer7，除了它们每个上面都有以下4个掩码:(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)contig内歧义掩码(AMB掩码)，(3)RepeatMasker中的重复掩码(RM掩码)，以及(4)Tandem repeats Finder中的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . drerio . ucsc . danrer7 .mask ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7
进口	BSgenome，BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked/
软件包下载报告	下载数据