BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.masked

完整的蒙面基因组序列犬属狼疮后裔(canFam3 UCSC的版本)

Bioconductor版本:版本(3.16)

完整基因组序列犬属狼疮后裔(狗)提供的UCSC (canFam3, 2011年9月)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Cfamiliaris.UCSC序列是一样的。canFam3,除了他们每个人上面具后的4:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具),(3)重复的面具RepeatMasker (RM面具),和(4)串联重复序列的重复的面具仪(扶轮基金会面具)。只有AGAPS和AMB面具默认是“活跃”的。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.masked”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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细节

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版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3
进口	BSgenome,BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3
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源包	BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.masked_1.3.99.tar.gz
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包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.masked/
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