BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked

牛全掩蔽基因组序列(UCSC版本bosTau6)

生物导体版本:发布(3.13)

牛牛全基因组序列由UCSC提供(bosTau6, 2009年11月)并存储在Biostrings对象中。序列与BSgenome.Btaurus.UCSC相同。bosTau6，除了它们上面都有以下4个掩码:(1)装配间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)内连续歧义掩码(AMB掩码)，(3)来自RepeatMasker的repeats掩码(RM掩码)，(4)来自Tandem repeats Finder的repeats掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“激活的”。

作者:Bioconductor开发团队

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

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如果(!BiocManager::install(" bs基因组. btaurus . ucsc . bostau6 .mask ")

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文档

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细节

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版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6
进口	BSgenome，BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6
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源包	BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked/
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