BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2.masked

蜜蜂全掩模基因组序列(UCSC版本apiMel2)

Bioconductor版本:发行版(3.16)

由UCSC (apiMel2, 2005年1月)提供并存储在Biostrings对象中的Apis mellifera(蜜蜂)的完整基因组序列。序列与BSgenome.Amellifera.UCSC相同。apiMel2，除了它们每个上面都有以下3个掩码:(1)组装间隙的掩码(AGAPS掩码)，(2)contig内歧义的掩码(AMB掩码)，以及(3)RepeatMasker中的重复的掩码(RM掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . amellifera . ucsc . apimel2 .mask ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

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版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2
进口	BSgenome，BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2
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包档案

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源包	BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2.masked_1.3.99.tar.gz
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macOS二进制文件(arm64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2.masked/
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