的openCyto包是使用电子表格来组成浇注方案。基本上，每一行都对应于门控层次结构树中的一个填充节点。然而，有时描述每一个人口是冗长的。因此，在这里我们将解释如何使模板更简洁，更容易通过使用组合流行而且别名模式。
流行= " + / - "对于1d/2d门控函数，我们通常通过设置感兴趣的是正的(表示门内的单元事件)或负的(或负的，表示门外的单元事件)流行列的形式+或-．但有时我们想为两者做下游门控。通过指定流行作为+/-,模板解析器将在内部展开为两行。
例如，这一行将自动展开
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| ＊ | +/- | cd3 | cd4 | mindensity |
到两行:
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| cd4 + | + | cd3 | cd4 | mindensity | |
| cd4 - | - | cd3 | cd4 | refGate | cd3、cd4 + |
注意，第二行使用refGate它简单地复制由计算的门坐标mindensity在第一行中，将负号赋给流行表示感兴趣的总体的列为cd4 -．
流行= " + + "我们经常需要在两个维度上分别应用一维门控函数，然后利用两个切割点进行构造rectangleGate来捕捉二维投影中某个特定象限内的细胞事件，例如，辅助T单元格通常表示为CD4 + CD8 -．而不是在模板中写三行，简单地使用++模式中的流行列。
如
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| 辅助T | +- | cd3 | cd4, cd8 | mindensity |
模板解析器将自动处理扩展。
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| cd4 + | + | cd3 | cd4 | mindensity | |
| cd8 + | + | cd3 | cd8 | mindensity | |
| 辅助T | +- | cd3 | cd4, cd8 | refGate | cd3、cd4 +: cd3 / cd8 + |
如我们所见，前两行进行实际的门控mindensity第三行简单地使用了这两个1d门的坐标(cd4 +而且cd8 +)，并建立一个rectangleGate(T助手)通过使用refGate作为gating_method．和+而且-与维度一起标记决定保留哪个象限。
流行= “+/-+/-”显然，我们想用同样的方法得到不止一个象限。例如，我们可以设置流行来+/-+/-保持所有四个象限。
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| ＊ | +/-+/- | cd3 | cd4, cd8 | mindensity |
它将扩展为六行:
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| cd4 + | + | cd3 | cd4 | mindensity | |
| cd8 + | + | cd3 | cd8 | mindensity | |
| cd4 + cd8 + | ++ | cd3 | cd4, cd8 | refGate | cd3、cd4 +: cd3 / cd8 + |
| cd4-cd8 + | -+ | cd3 | cd4, cd8 | refGate | cd3、cd4 +: cd3 / cd8 + |
| cd4 + cd8 - | +- | cd3 | cd4, cd8 | refGate | cd3、cd4 +: cd3 / cd8 + |
| cd4-cd8 - | - - - - - - | cd3 | cd4, cd8 | refGate | cd3、cd4 +: cd3 / cd8 + |
前两个做实际门控，其余四个使用两个1d门构造四个不同的rectangleGateS代表四个不同的象限。
流行= "*"和别名= " A, B, C "到目前为止，我们一直在讨论只返回一个gate对象(S4类扩展flowCore:过滤器)．如果我们想应用门控函数(例如。curv2filter或flowClust: tmixFilter)返回多个门，我们可以设置流行来＊中指定多个填充名称别名用逗号分隔的字符。
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| CD4, CD8 | ＊ | cd3 | cd4, cd8 | curv2gate |
这里我们假设curv1gate总是返回两个盖茨的顺序是c (cd4, cd8)，则输入总体名称别名列将匹配到这两个门和两个dummy_gate生成的行仅作为要使用的引用
作为父下游闸门节点。
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| CD4, CD8 | ＊ | cd3 | cd4, cd8 | curv2gate | |
| CD4 | cd3 | cd4, cd8 | dummy_gate | cd3、CD4、CD8 | |
| CD8 | cd3 | cd4, cd8 | dummy_gate | cd3、CD4、CD8 |
流行= "”,别名= "”如果我们不知道有多少门会回来curv2gate或者门的顺序是不确定的，因此我们将无法命名这些种群。只要它们不被用作父节点用于进一步的门控(即。终端门S)，我们可以简单地设别名来＊．
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| ＊ | ＊ | cd3 | cd4, cd8 | curv2gate |
中不会展开openCyto框架。但是，将生成多个填充并添加到GatingSet对象。它们被命名为filterId槽的过滤器对象。
父= " A, B, C ")如果相同的浇注方法(或简单refGate)需要应用到多个父级，可以将它们写入单行。例如,
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| IL2 + | + | cd4, cd8 | IL2 | refGate | cd3 / IL2 + |
属性将该行解释为复制IL2已生成的门cd3并应用于cd4而且cd8，相当于下面的行
| 别名 | 流行 | 父 | 会变暗 | gating_method | gating_args |
|---|---|---|---|---|---|
| IL2 + | + | cd4 | IL2 | refGate | cd3 / IL2 + |
| IL2 + | + | cd8 | IL2 | refGate | cd3 / IL2 + |