# #——包括= FALSE,回声= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - #日期:“‘r doc_date ()”“#”“r pkg_ver (BiocStyle)”“## #——回声= FALSE,结果=“隐藏”,消息= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -要求(knitr)美元opts_chunk组(错误= FALSE,消息= FALSE,警告= FALSE) # #——风格,呼应= FALSE,结果=“黑名单”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - BiocStyle::减价()# #——回声= FALSE, fig.cap =“可再生的信号矩阵”。宽度=‘100%’——knitr: include_graphics (Marr_schematic.png) # #——load-lib,消息= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(marr) # #——data-1,消息= FALSE,警告= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -数据(“msprepCOPD”) msprepCOPD # #——Marr_output - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(marr) Marr_output < -马尔(msprepCOPD pSamplepairs = 0.75, pFeatures = 0.75,α= 0.05)Marr_output # #的可再生的样本对每代谢物(特性)头(MarrFeatures (Marr_output)) # #的可再生的代谢物(特性)样本两头(MarrSamplepairs (Marr_output)) # # %可再生的样本对代谢物(特性)# #大于75% MarrFeaturesfiltered (Marr_output) # # %可再生的代谢物(每个样本特性)对# #大于75% MarrSamplepairsfiltered (Marr_output) # #——无花果。帽=“可再生的代谢产物的分布”,plot-Marr-Samplepairs——MarrPlotSamplepairs (Marr_output) # #——无花果。帽= "可再生的样本分布对",plot-Marr-Metabolites——MarrPlotFeatures (Marr_output) # #——byFeatures - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # #过滤数据由可再生的特性MarrFilterData (Marr_output, =“特性”)# #过滤由可再生的样本数据对MarrFilterData (Marr_output, =“samplePairs”) # #过滤的数据特征和样本对MarrFilterData (= Marr_output,“两”)# #——session-info - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sessionInfo ()