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1稳健概率平均(RPA)

稳健概率平均(RPA)是一种完全可扩展的算法,用于任何大小的短寡核苷酸微阵列集合的探针级预处理和分析,从中等大小的标准数据集到涉及数万个样本的任意大的微阵列图集。

特殊的包装可用于Affymetrix基因表达阵列和系统发育微阵列(HITChip)。

RPA还基于严格的概率模型提供了探针特定亲和性和噪声的明确数据驱动估计,并在基准测试中显著优于标准RMA模型(NAR 2013),同时实现了充分的可扩展性。

1.1如何使用

该方法可在R / Bioconductor,并在以下列出的出版物中记录。有关所有安装和使用说明,请参阅战维基

1.2援引战

RPA方法在这两种出版物中都有记载。如有必要,请注明: