# #——风格,包括= FALSE,结果=“隐藏”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - BiocStyle::减价()库(引导)库(裂变)图书馆(SummarizedExperiment)图书馆(ROCpAI) # #——安装、eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # devtools:: install_github (“juanpegarcia / ROCpAI”) # #——回声= FALSE,包括= FALSE,结果=“隐藏”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -数据(“裂变”)< - as.data.frame基因(cbind(应变<——colData(裂变)应变美元,t(化验(裂变)[c (“SPNCRNA.1080”、“SPAC186.08c”,“SPNCRNA.1420”、“SPCC70.08c”、“SPAC212.04c”),)))) colnames(基因)< - c(“应变”,“Gene1”,“Gene2”、“Gene3”、“Gene4”、“Gene5”) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -基因# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - pointsCurve基因(基因[1],[2])# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - resultMc < - mcpAUC(基因、低。值= 0,。值= 0.25,= TRUE) resultMc # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -测试。Mc < -试验(resultMc)测试。Mc St_pAUC # #美元- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -测试。Mc pAUC # #美元- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - resultsT < - tpAUC(基因、低。值= 0,。值= 0.25,= TRUE) resultsT # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -测试。tpAUC < -试验(resultsT) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -测试。tpAUC St_pAUC # #美元- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -测试。tpAUC pAUC # #——警告美元=“隐藏”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - resultstboot < - tpAUCboot(基因、低。值= 0,。值= 0.25)# #——回声=“隐藏”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -测试。tpAUCboot < -试验(resultstboot) resultT < - t (as.data.frame (cbind (test.tpAUCboot Tp_AUC美元,美元test.tpAUCboot sd, test.tpAUCboot轻水反应堆美元,美元test.tpAUCboot upr))) colnames (resultT) < - c (“Gene1”、“Gene2”,“Gene3”、“Gene4”、“Gene5”) rownames (resultT) < - c (“Tp_AUC”、“sd”、“轻水反应堆”,upr) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - resultT # #——警告=“隐藏”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - resultsMcboot < - mcpAUCboot(基因、低。值= 0,。值= 0.25)# #——回声=‘隐藏’,结果=“隐藏”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -测试。mcpAUCboot < -试验(resultsMcboot) resultMc < - t (as.data.frame (cbind (test.mcpAUCboot MCp_AUC美元,美元test.mcpAUCboot sd, test.mcpAUCboot轻水反应堆美元,美元test.mcpAUCboot upr))) colnames (resultMc) < - c (“Gene1”、“Gene2”,“Gene3”、“Gene4”、“Gene5”) rownames (resultMc) < - c (“MCp_AUC”、“sd”、“轻水反应堆”,upr) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - resultMc # #——sessionInfo, eval = TRUE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sessionInfo ()