# #——风格,呼应= FALSE,结果=“黑名单”,消息= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - BiocStyle::减价()# # - - - - -设置,消息= FALSE,回声= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(“PSMatch”) # #——消息= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -(防晒指数< - msdata::蛋白质组学(模式= " 2014 ",full.names = TRUE))库(光谱)sp < -光谱(spf) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - (idf < - msdata::鉴别(模式= " 2014 ",full.names = TRUE)) id < - PSM (idf) | > filterPSMs id () # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sp < - joinSpectraData (sp, id。x =“spectrumId”。y =“spectrumID”) sp # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sp5449 < - filterPrecursorScan (sp, 5449) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - plotSpectra (sp5449 [1], xlim = c (550、1200)) abline (v = precursorMz (sp5449)[2],坳=“红色”,lty =“点缀”)# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sp5449序列# #美元- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - calculateFragments (sp5449序列[2]美元)# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - plotSpectra (sp5449 [2]) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - plotSpectra (sp5449[2],标签= addFragments labelPos = 3) # # - - - - - si - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sessionInfo ()