### R代码从vignette源的LRBaseDbi。Rnw ' ################################################### ### 代码块1号:style-Sweave ################################################### BiocStyle:乳胶 () ################################################### ### 代码块2号:LRBaseDbi。Rnw: 53-60 ################################################### 库(LRBaseDbi)库(“AnnotationHub”)啊< - AnnotationHub () dbfile < -查询(啊,c(“LRBaseDb”、“野猪”,“v001”))([1])#构造函数LRBase.Ssc.eg.db < - LRBaseDbi:: LRBaseDb (dbfile ) ################################################### ### 代码块3号:LRBaseDbi。Rnw: 73 - 80 ################################################### 如果(互动()){(关口< -列(LRBase.Ssc.eg.db)) keytypes (LRBase.Ssc.eg.db) (ks < -键(LRBase.Ssc.eg.db, keytype = ' GENEID_R ')) (select (LRBase.Ssc.eg.db键= ks[1:2],列= c(“GENEID_L”、“GENEID_R”),keytype = ' GENEID_R ')) } ################################################### ### 代码块数量4:LRBaseDbi。Rnw: 97 - 117 ################################################### 如果(互动()){#显示LRBase.Ssc.eg.db # dbconn dbconn (LRBase.Ssc.eg.db) # dbfile dbfile (LRBase.Ssc.eg.db) # dbschema dbschema (LRBase.Ssc.eg.db) # dbInfo dbInfo (LRBase.Ssc.eg.db) #物种的物种(LRBase.Ssc.eg.db) # lrNomenclature lrNomenclature (LRBase.Ssc.eg.db) # lrListDatabases lrListDatabases (LRBase.Ssc.eg.db) # lrVersion lrVersion (LRBase.Ssc.eg.db ) } ################################################### ### 代码块数量5: LRBaseDbi。Rnw: 138 - 146 ################################################### 如果(互动()){(!requireNamespace('BiocManager'， quiet = TRUE)){install.packages('BiocManager')} BiocManager::install('scTensor') library('scTensor') vignette('scTensor')}