# #——回声= FALSE,结果=“隐藏”,消息= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -要求(knitr)美元opts_chunk组(错误= FALSE,消息= FALSE,警告= FALSE) # # - - - - -设置,呼应= FALSE,消息= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(BiocSingular) set.seed(100) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -假< -矩阵(rnorm (10000), ncol = 25) e。< - runSVD(假,k = 10, BSPARAM = ExactParam ()) str (e.out) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - set.seed(1000)我。< - runSVD(假,k = 10, BSPARAM = IrlbaParam ()) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - set.seed (1000) r。< - runSVD(假,k = 10, BSPARAM = RandomParam ()) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - epam < - ExactParam(折= 10)epam cr.out < - runSVD(假,k = 10, BSPARAM = epam) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cs。< - runSVD(假,k = 10,规模= runif (ncol(假),中心= rnorm (ncol(虚拟)))# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - set.seed (2000) def.out < - runSVD(假,k = 10,规模= runif (ncol(假),中心= rnorm (ncol(假),BSPARAM = IrlbaParam(延迟= TRUE)) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ipam < - IrlbaParam (tol = 1 e-8 extra.work = 10) ipam # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - set.seed(3000)我。< - runSVD(假,k = 10, BSPARAM = ipam) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - set.seed图书馆(BiocParallel)我(4000)。< - runSVD(假,k = 10, BSPARAM = ipam BPPARAM = BPPARAM()) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -个人电脑。< - runPCA(假,等级= 10,BSPARAM = ExactParam ()) str (pcs.out) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -头(pcs.out x美元)# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sessionInfo ()