# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - suppressMessages(库(MultiAssayExperiment))稍后通知< - readRDS(执行(“extdata”、“training.tba.toydata。rds”,包= " AffiXcan ")) # #这是MultiAssayExperiment对象名称(化验(稍后通知))# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -化验(稍后通知)美元ENSG00000139269.2 [1:5, 1:4] # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - suppressMessages(库(SummarizedExperiment))负载(“. . /数据/ exprMatrix.RData”)化验(exprMatrix)美元值[1:5]# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -负载(“. . /数据/ regionAssoc.RData”) regionAssoc[1:3], # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -负载(“. . /数据/ trainingCovariates.RData”)头(trainingCovariates) # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - suppressMessages(库(“AffiXcan”)) trainingTbaPaths < -执行(“extdata”、“training.tba.toydata。rds”,包= " AffiXcan ")数据(exprMatrix)数据(regionAssoc)数据(trainingCovariates)分析< -“价值观”培训< affiXcanTrain (exprMatrix = exprMatrix化验=化验,tbaPaths = trainingTbaPaths regionAssoc = regionAssoc x = trainingCovariates varExplained = 80,规模= TRUE) testingTbaPaths < -执行(“extdata”、“testing.tba.toydata。rds”,包= " AffiXcan”) exprmatrix < - affiXcanImpute (tbaPaths = testingTbaPaths affiXcanTraining =培训规模= TRUE) grexMatrix < -化验(exprmatrix)美元GReX as.data.frame (grexMatrix) [1:5] # # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - trainingTbaPaths < -执行(“extdata”、“training.tba.toydata。rds”,包= " AffiXcan ")数据(exprMatrix)数据(regionAssoc)数据(trainingCovariates)分析< -“价值观”培训< affiXcanTrain (exprMatrix = exprMatrix化验=化验,tbaPaths = trainingTbaPaths regionAssoc = regionAssoc x = trainingCovariates varExplained = 80,规模= TRUE, kfold = 5)