RNBEADS是一个R包，用于全面分析使用任何实验方案获得的DNA甲基化数据，该协议提供了单个CPG分辨率，包括Infinium 450K微阵列和Bisulfite测序方案方案，以及一旦数据已与DNA预先处理DNA，也是MEDIP-SEQ和MBD-SEQ甲基化推理软件。RNBeads实现了比现有工具的分析工作流程更全面的分析工作流程。它将其结果记录在高度注释且可读的超文本报告中，并扩展到大型样本量，这些样本量成为人类同胞中DNA甲基化分析的规范。