版本1.14.0的变化-------------------新功能o添加功能来解析MEME输出。o增加并行计算的searchSeq。版本1.12.0的变化-------------------错误修复o修复PFMSimilarity中的一个错误。修正了motif矩阵有多个类时的错误。readJASPARMatrix函数添加JASPAR格式文件。版本1.10.0的变化-------------------错误修复o适应runMEME与meme 4.10工作。x版本。o修复科学符号在run_MEME o更好的错误处理MEME包装变化在版本1.9.4 ------------------------新功能o添加转换从IUPAC字符串到矩阵o toPWM, toICM工作在PFMatrixList错误修复o修复seqLogo错误时，每个基地的频率是相同的在某些站点。多亏了莉兹。修复了JASPAR2016中处理某些TFBS重复/缺失记录的数据库接口。修复某些情况下强制方法失败。 CHANGES IN VERSION 1.7.2 ------------------------ NEW FEATURES o New class TFFMFirst and TFFMDetail for next generation TFBSs. o Novel TFFM sequence logo. BUG FIXES o Fix the bug in runMEME, which always return positive strand for site sequence. CHANGES IN VERSION 1.5.0 ------------------------ NEW FEATURES o searchSeq now works on DNAStringSet. The names in DNAStringSet will be used as seqname in SiteSet. o More user-friendly output in data.frame or GRanges from SiteSet, SiteSetList, et al. o reverseComplement works on XMatrix now. o faster implmentation of searchPairBSgenome