新闻/ CHANGELOG R4RNA_1.0.0 2015-10-27(丹尼尔赖 )-现在接受Biostrings XStringSet作为有效的多序列比对输入-删除readFasta和writeFasta功能,请使用readBStringSet和writeXStringSet代替。——colourByValue处理单值和空螺旋病例——isConflictingHelix isDuplicatingHelix isOverlapping螺旋现在返回一个十进制值从0到1,而不是虚假或真实价值与多个完全当面临一个螺旋分类。这使得阈值由用户和功能也快得多。——添加情节R4RNA_0.1.4.tar asp选项。广州2012-03-21(丹尼尔赖 )- structureMismatchScore和sequencePercentGaps添加“垫”参数用于指定填充blankPlot -补充道“没有。blankPlot par”选项,允许par (mfrow =…),等等——取代冲突。过滤器的冲突。上校和冲突。lty plotCovariance -固定错误collapseHelix R4RNA_0.1.3.tar。广州2012-02-16(丹尼尔赖 )- - -最新的装饰图案,获得通过装饰图案R4RNA_0.1.2.tar (“R4RNA”)。广州2012-02-15(丹尼尔赖 )——改善colourBy功能(默认参数+选项)- basepairFrequency和colourByBasepairFrequency添加日志空间操作,logseq, logfloor logceiling——R4RNA_0.1.1.tar例子在手动更新,以反映更改。广州2012-02-14(丹尼尔赖 )——包修订出版NAR方法在线-功能的改善用户体验的各种“ColourBy”功能——除了对齐统计功能——文件阅读功能的强大和能够处理多个条目,各种格式转换函数与螺旋- plotDoubleCovariance和plotOverlapCovariance功能添加很多微调目的plotCovariance——更大的作用和功能blankPlot——允许直接输出png或pdf文件,改进和扩展文档R4RNA_0.1.0.tar。广州2011-12-16(丹尼尔赖 )——首次公开发布