版本1.8.0的变化- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o扩展支持基准测试用户定义的输入:-混合的预定义和用户定义的浓缩方法(函数“runEA”和“evalTypeIError”)——附加参数的简化传递函数定义的浓缩方法“runEA”和“evalTypeIError”o TCGA RNA-seq纲要现在还可以获得通过curatedTCGAData使用“loadEData (“TCGA”模式=“供”)的变化版本1.6.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - o新功能“evalTypeIError”:第一类误差评价样本排列-评价> > = 1 = 1浓缩方法表达数据集——支持分裂排列成块的大小定义调用并行分区评价o +新功能“evalRandomGS”评价随机基因集:——估计比例的拒绝零假设(=分数重要的基因集)的浓缩方法应用随机基因集的大小定义- > = 1浓缩方法的评价一个表达式的数据集选择o新参数“方法”“evalRelevance”功能表型相关的基因集的评价排名,选择包括:——“wsum”:计算加权和的相关性分数(默认),——“auc”:执行一个民国/ auc分析基于ROCR包,——“心脏”:计算标准的相关性如斯皮尔曼等级相关,——自定义一个用户定义的函数的行为。o新功能“metaFC”总结褶皱变化的个人数据集的表达数据集o新功能“plotDEDistribution”和“plotNrSamples”探索微分表达式和样本大小的表达数据集o扩展支持用户定义的基准测试的输入包括简化插件定义的浓缩方法(由于马塞尔·拉莫斯@LiNk-NY)