版本2.0.1的更改 - 修复了LogLogisticRegress中的错误，导致测试在生物通用器中失败3.16每日构建版本2.0.0中的更改 - @cell插槽已成为@Sample插槽。相关的仿制药和访问者方法已重命名，然后将其与旧名称相称。因此，旧代码仍应按预期工作，但实际上将调用不同的S4方法。- 将@Treatment插槽添加到CoreSet级 - 重命名为@sensitity插槽中@TreatmentResponse版本1.5.8-修复了CoreSet2构造函数的固定导入，以在版本1.5.7中的PharmacoGX更改中解决错误，以解决1.5.7的PharmAcogx更改 - 添加处理RessectResponsexpermiment类别，添加治疗方法，一个简单的包装器围绕长期列表，以使类语法更特定于域 - 添加CoreSet2结构，以支持Bioc 3.13中引入的修改类结构的核心的创建 - 现在可以通过治疗组合实验通过处理Restressponseponseexexperiment类制成！版本1.5.6中的更改 - 修复了LongTable-> data.Table Coerce方法中的错误，该方法导致了一些要删除某些测定的行（CLOSES ISSEAL＃）1.5.5中的更改 - 修复了.distancePointLine中的bug。拦截指定的（第120期） - 添加了对汇总长期类对象内部的测定的支持 - 核心构造器的一些过程内更新将用于秋季版本 - 修复了治疗名称中的错误示例 - 修复了Roxygen2文档警告。关于S4方法文档 - 对使用LongTabledAppApper类的长塔可胁迫方法进行了大修，而不是版本1.5.4中的不推荐使用的'longtable.config'属性更改 - 修复$ < - 和[[<--返回值的方法而不是更新的方法）对象 - 修复了由长度> 1迫使对逻辑向量变化1.5.3中的变化引起的.sanitize输入的错误 - 修复了由长度> 1胁迫向逻辑矢量引起的连接镜中的错误；这应该修复由RADIOGX和Pharmacogx小插图中的错误，这些错误是由RCMD构建1.5.2中失败的构建变化引起的 - 添加coreet对象的子setBysample方法； this is the first step in modularizing the subset methods for reuse in dependent packages - Added a CoreSet-utils documentation section to document subset, intersect, combine and other set operations for a CoreSet object. Changes in version 1.5.1 - Fixed some spelling errors and incorrect code chunk configurations in the LongTable vignette - Fix bug in .rebuildProfiles where the function fails if replicate_id is assigned as a rowID column in the LongTable in @sensitivity Changes in version 1.5.0 - Bioconductor spring 2021 release - Added the DataMapper abstract class - Added the LongTableDataMapper concrete class - Added the metaConstruct method, for making an S4 object from a sub-class of DataMapper - Updated LongTable vignette with documentation for the DataMapper and LongTableDataMapper - Refactored various methods to work with a LongTable in @sensititivty - Refactored various methods to work with a MultiAssayExperiment in @molecularProfiles Changes in version 1.1.5 - Implemented a new class, the LongTable, to store the results of a treatment response experiment. This class provides a flexible and fast data storage object which can be subclassed for use in other R packages. - Added vignette documenting LongTable accessors and usage of the new object. Changes in version 1.0.2 - Bug fix: suppress warnings thrown by piano::runGSA inside the connectivitScore function Changes in version 1.0.1 - Updated the CoreGx vignette to include more information on extending the CoreSet class for use in other treatment-response experiments. Changes in version 1.0.0 - Implemented molecularProfiles as SummarizedExperiments instead of ExpressionSets - Modifying generic implementation to add ...; allows for additional arguments in setMethods() for CoreGx generics - Removing package from CRAN - Submitting package to Bioconductor