1.1.5变化版本(2016-08-23)+我们固定一个bug .addTLB()(称为estimateTechnicalNoise()),减少了使用的trans-count箱子数量,尽管这些箱子的阅读数量仍正确计算。自修复这个bug trans-count垃圾箱的数量增加,我们相应地调整两个设置的默认值:o tlb。minProxOEPerBin: 1000更改为50000 o tlb。minProxB2BPerBin: 100更改为2500 o这些值已被选定,以确保结果应该改变从芝加哥1.1.4尽可能少。除非你是使用自定义的值,你不应该注意任何定性差异。o如果需要重新运行chicagoPipeline()(或只是estimateTechnicalNoise())在chicagoData对象创建使用版本1.1.4或更早,请手动更新他们的新设置的参数:o cd < - modifySettings (cd,设置= (tlb列表。minProxOEPerBin = 50000, tlb.minProxB2BPerBin = 2500) o许多感谢托马斯·塞克斯顿把错误对我们的关注和帮助我们修复它。改变版本1.13(2019-24-10)+基于.npb违约现在更新文件头而不仅仅是检查他们的一致性。+使用芝加哥与four-cutter酶时,确保你减少minFragLen参数。然而,这只能现在做当生成设计文件,而不是在R包本身。版本变化1.17.1(2020-09-08)+固定一个小错误,影响距离函数估计在某些情况下,特别是当使用four-cutter酶。