Zinbwave
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doi：10.18129/b9.bioc.zinbwave
RNA-seq数据的零泄漏的负二项式模型
生物导体版本：版本（3.13）
实现通用且灵活的零膨胀的负二项模型，该模型可用于提供单细胞RNA-seq数据的低维表示。该模型解释了零通货膨胀（辍学），过度分散和数据的计数性质。该模型还解释了库大小的差异以及批处理效果和/或其他协变量的差异，从而避免了对数据进行预伸缩的需求。
作者：Davide Risso [AUT，CRE，CPH]，Svetlana Gribkova [aut]，Fanny Perraudeau [aut]，Jean-Philippe Vert [aut]，Clara Bagatin [aut]
维护者：davide risso
引用（从r内，输入引用（“ zinbwave”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ zinbwave”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Zinbwave”）
| html | R脚本 | Zinbwave Vignette |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.14.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（3.5岁） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.4），方法，总结性特征，，，，Singlecellexperiment |
| 进口 | 生物比较，，，，软增生，统计GeneFilter，，，，EDGER，，，，矩阵 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，矩阵，，，，马格里特，，，，scrnaseq，，，，GGPLOT2，，，，Biomart，，，，生物使用，，，，RTSNE，，，，deseq2 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/drisso/zinbwave/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 簇发酵，，，，SCBFA，，，，Singlecelltk |
| 建议我 | 桅杆，，，，飞溅 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Zinbwave_1.14.1.tar.gz |
| Windows二进制 | zinbwave_1.14.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | Zinbwave_1.14.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zinbwave |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/zinbwave |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/zinbwave/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.13的旧源软件包 | 来源存档 |
